Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'18-Segment pdb2noq1E.i4-23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2noq:E (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF RIBOSOME-BOUND CRICKET PARALYSIS VIRUS IRES RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 25S RIBOSMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 7.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (4, 23) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UGCGUAGGAUAGGUGGGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: O4'-endo, 4: C4'-exo, 9: C4'-exo, 11: O4'-endo, 12: C1'-exo, 19: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |