Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-2-Internal Loop pdb2jtp1A.n1-34 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2jtp:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | SOLUTION STRUCTURE OF THE FRAMESHIFT-INDUCING RNA STEM-LOOP IN SIV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | SIV17-50 RNA (34-MER) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (11, 24), (15, 21) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAA_-_AA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 6: C2'-exo, 7: C2'-exo, 9: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||