Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '8-5-Internal Loop pdb2j03FA.n680-818 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2j03:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME COMPLEXED WITH MRNA, TRNA AND PAROMOMYCIN (PART 4 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FROM MOLECULE II. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (681, 817), (687, 808) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AGAUAGCU_-_CGAAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C2'-endo, 13: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
13: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||