Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'19-Segment pdb2j011A.i510-530 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 2j01:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME COMPLEXED WITH MRNA, TRNA AND PAROMOMYCIN (PART 2 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FROM MOLECULE I. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (510, 530) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGUGAAAUAGAGCCUGAAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
8: C2'-endo, 11: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
8: syn, 11: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |