Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'6-6-1-1-6-Multiloop pdb2j001A.m48-350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2j00:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME COMPLEXED WITH MRNA, TRNA AND PAROMOMYCIN (PART 1 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, A-, P- AND E- SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE I. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (50, 348), (57, 95), (102, 305), (307, 328), (330, 341) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AUGCAA_-_GGACGG_-_A_-_A_-_GCAGCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: C2'-exo, 7: C2'-endo, 12: C2'-endo, 18: C2'-endo, 24: C2'-endo, 26: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
11: syn, 12: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Structural Clusters |