Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-6-Internal Loop pdb2i2v1B.n76-110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2i2v:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF RIBOSOME WITH MESSENGER RNA AND THE ANTICODON STEM-LOOP OF P-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT OF ONE 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.22 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (82, 104), (85, 97) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AA_-_GUUAUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C2'-endo, 10: C3'-exo, 11: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |