Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'8-1-Internal Loop pdb2i2t1B.n2101-2120 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2i2t:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF RIBOSOME WITH MESSENGER RNA AND THE ANTICODON STEM-LOOP OF P-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT OF ONE 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.22 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2092, 2128), (2101, 2120) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UGGAAGUG_-_U_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 4: C2'-endo, 13: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |