Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '9-3-Internal Loop pdb2hvy1E.n19-48 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2hvy:E (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF AN H/ACA BOX RNP FROM PYROCOCCUS FURIOSUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | H/ACA RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (9, 58), (19, 48) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UUGAGUGUA_-_UAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 5: C3'-exo, 6: unknown, 7: C2'-exo, 10: C1'-exo, 11: C3'-exo, 12: C2'-endo, 13: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: unknown, 11: syn, 13: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||