Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '9-Segment pdb2hoj1A.i29-39 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2hoj:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF AN E. COLI THI-BOX RIBOSWITCH BOUND TO THIAMINE PYROPHOSPHATE, MANGANESE IONS | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | THI-BOX RIBOSWITCH | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (29, 39) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UGAGAAAUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: O4'-endo, 7: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn, 8: syn, 9: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||