Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-4-Internal Loop pdb2hgr1A.n1398-1453 | |||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2hgr:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | 70S T.TH. RIBOSOME FUNCTIONAL COMPLEX WITH MRNA AND E- AND P-SITE TRNAS AT 4.5A. THIS ENTRY 2HGR CONTAINS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT CAN BE FOUND IN PDB ENTRY 2HGU. | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RRNA | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 4.51 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (1409, 1442), (1415, 1437) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAAGU_-_CCGA_ | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
8: C4'-exo, 10: C4'-exo, 11: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||