Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-6-Internal Loop pdb2hgq1A.n2503-2561 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2hgq:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE 70S THERMUS THERMOPHILUS RIBOSOME WITH TRANSLOCATED AND ROTATED SHINE-DALGARNO DUPLEX. THIS ENTRY 2HGQ CONTAINS 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT CAN BE FOUND IN PDB ENTRY 2HGP. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 5.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2500, 2568), (2503, 2561) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UC_-_ACGCGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C4'-exo, 6: C2'-exo, 9: C4'-exo, 11: C2'-exo, 12: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |