Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '12-Segment pdb2hgq1A.i381-394 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2hgq:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE 70S THERMUS THERMOPHILUS RIBOSOME WITH TRANSLOCATED AND ROTATED SHINE-DALGARNO DUPLEX. THIS ENTRY 2HGQ CONTAINS 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT CAN BE FOUND IN PDB ENTRY 2HGP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 5.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (381, 394) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UAGGUGAGGGUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
5: C4'-exo, 13: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||