Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'22-Segment pdb2hgq1A.i1105-1128 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2hgq:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE 70S THERMUS THERMOPHILUS RIBOSOME WITH TRANSLOCATED AND ROTATED SHINE-DALGARNO DUPLEX. THIS ENTRY 2HGQ CONTAINS 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT CAN BE FOUND IN PDB ENTRY 2HGP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 5.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1105, 1128) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo, 5: O4'-endo, 6: C4'-exo, 9: C2'-exo, 14: C2'-exo, 19: C2'-exo, 20: C2'-exo, 24: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn, 7: syn, 15: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |