Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-5-Internal Loop pdb2hgpFA.n1398-1453 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2hgp:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE 70S THERMUS THERMOPHILUS RIBOSOME WITH TRANSLOCATED AND ROTATED SHINE-DALGARNO DUPLEX. THIS ENTRY 2HGP CONTAINS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT CAN BE FOUND IN PDB ENTRY 2HGQ. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
16S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 5.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1409, 1442), (1415, 1437) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CCGA_-_GAAGU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo, 4: C4'-exo, 5: C2'-exo, 6: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |