Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '4-5-Internal Loop pdb2hgj1A.n881-945 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2hgj:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE 70S THERMUS THERMOPHILUS RIBOSOME SHOWING HOW THE 16S 3'-END MIMICKS MRNA E AND P CODONS. THIS ENTRY 2HGJ CONTAINS 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT CAN BE FOUND IN PDB ENTRY 2HGI. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 5.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (883, 943), (888, 937) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUAG_-_CCGAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-exo, 5: C2'-exo, 11: C2'-exo, 13: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 12: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||