Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '2-3-Internal Loop pdb2hgj1A.n1464-1576 | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2hgj:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE 70S THERMUS THERMOPHILUS RIBOSOME SHOWING HOW THE 16S 3'-END MIMICKS MRNA E AND P CODONS. THIS ENTRY 2HGJ CONTAINS 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT CAN BE FOUND IN PDB ENTRY 2HGI. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 5.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1461, 1580), (1464, 1576) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UA_-_GAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 2: C2'-exo, 6: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||