Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '22-Segment pdb2gyc10.i2094-2117 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2gyc:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE 50S SUBUNIT OF A SECM-STALLED E. COLI RIBOSOME COMPLEX OBTAINED BY FITTING ATOMIC MODELS FOR RNA AND PROTEIN COMPONENTS INTO CRYO-EM MAP EMD-1143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (2094, 2117) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GACAGUGUCUGGUGGGUAGUUU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: C2'-exo, 19: C2'-exo, 21: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
16: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||