Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '2-5-Internal Loop pdb2gybFA.n1394-1420 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2gyb:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE 30S SUBUNIT OF A SECM-STALLED E. COLI RIBOSOME COMPLEX OBTAINED BY FITTING ATOMIC MODELS FOR RNA AND PROTEIN COMPONENTS INTO CRYO-EM MAP EMD-1143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
16S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 2.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1399, 1415), (1405, 1412) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GC_-_AGCAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn, 9: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||