Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-4-Internal Loop pdb2gyaF0.n637-669 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 2gya:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE 50S SUBUNIT OF A PRE-TRANSLOCATIONAL E. COLI RIBOSOME OBTAINED BY FITTING ATOMIC MODELS FOR RNA AND PROTEIN COMPONENTS INTO CRYO-EM MAP EMD-1056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (639, 667), (644, 661) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GGAGG_-_UGAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |