Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '4-4-Internal Loop pdb2gya10.n1278-1299 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2gya:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE 50S SUBUNIT OF A PRE-TRANSLOCATIONAL E. COLI RIBOSOME OBTAINED BY FITTING ATOMIC MODELS FOR RNA AND PROTEIN COMPONENTS INTO CRYO-EM MAP EMD-1056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1280, 1297), (1285, 1292) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAGG_-_CGUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
9: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||