Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'24-Segment pdb2gya10.i1485-1510 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2gya:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE 50S SUBUNIT OF A PRE-TRANSLOCATIONAL E. COLI RIBOSOME OBTAINED BY FITTING ATOMIC MODELS FOR RNA AND PROTEIN COMPONENTS INTO CRYO-EM MAP EMD-1056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1485, 1510) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CAGGAAAAGCUUCUAAACGUUGAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
14: C4'-exo, 15: C4'-exo, 16: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |