Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-3-Internal Loop pdb2gdi1Y.n54-67 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2gdi:Y (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THIAMINE PYROPHOSPHATE-SPECIFIC RIBOSWITCH IN COMPLEX WITH THIAMINE PYROPHOSPHATE | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | TPP RIBOSWITCH | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.05 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (50, 71), (54, 67) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAU_-_CGU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 4: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||