Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-Hairpin pdb2gdi1Y.e18-24 | |||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2gdi:Y (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THIAMINE PYROPHOSPHATE-SPECIFIC RIBOSWITCH IN COMPLEX WITH THIAMINE PYROPHOSPHATE | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | TPP RIBOSWITCH | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 2.05 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (18, 24) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UGCGU_ | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 7: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||