Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'9-Segment pdb2gdi1X.i29-39 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2gdi:X (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THIAMINE PYROPHOSPHATE-SPECIFIC RIBOSWITCH IN COMPLEX WITH THIAMINE PYROPHOSPHATE | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | TPP RIBOSWITCH | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.05 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (29, 39) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UGAGAAAUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: C1'-exo, 7: C2'-endo, 8: C2'-exo, 9: C1'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn, 8: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Structural Clusters |