Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-Hairpin pdb2g1w1A.e4-10 | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2g1w:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||
| Source: Information | NMR STRUCTURE OF THE AQUIFEX AEOLICUS TMRNA PSEUDOKNOT PK1 | ||||||||||||||||||
| Source: Compound | 5'- | ||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||
| Position | (4, 10) | ||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UGGCU_ | ||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C1'-exo, 3: C4'-exo, 6: C2'-endo | ||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||