Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-5-Internal Loop pdb2f4v1A.n1392-1459 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 2f4v:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | 30S RIBOSOME + DESIGNER ANTIBIOTIC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1394, 1457), (1400, 1451) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GAGCG_-_CGUGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: O4'-endo, 7: C2'-exo, 13: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |