Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-4-Internal Loop pdb2e5lFA.n144-159 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2e5l:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | A SNAPSHOT OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT CAPTURING MRNA VIA THE SHINE- DALGARNO INTERACTION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
16S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 3.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (139, 165), (144, 159) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CUAAU_-_ACAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 2: C1'-exo, 6: C4'-exo, 9: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||