Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '11-Segment pdb2e5l1A.i693-705 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2e5l:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | A SNAPSHOT OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT CAPTURING MRNA VIA THE SHINE- DALGARNO INTERACTION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (693, 705) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAACGCCGAUG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 5: O4'-endo, 6: C2'-exo, 7: C4'-exo, 8: C2'-exo, 9: O4'-endo, 11: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||