Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-9-Internal Loop pdb2d3o10.n1370-1526 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2d3o:0 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF RIBOSOME BINDING DOMAIN OF THE TRIGGER FACTOR ON THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM D. RADIODURANS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.35 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1372, 1524), (1377, 1514) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GGAC_-_CAAGAAAAG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-exo, 8: C4'-exo, 10: C2'-exo, 17: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
9: syn, 11: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |