Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'9-Segment pdb2cky1B.i26-36 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2cky:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE ARABIDOPSIS THALIANA THIAMINE PYROPHOSPHATE RIBOSWITCH WITH ITS REGULATORY LIGAND | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | NUCLEIC ACID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.90 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (26, 36) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UGAGAAAGU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: C2'-endo, 7: C2'-endo, 8: C2'-exo, 9: C4'-exo, 10: O4'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn, 7: syn, 10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Structural Clusters |