Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'7-4-Internal Loop pdb2b9pFA.n2618-2625 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2b9p:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | 50S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME IN COMPLEX WITH TRNAS AND MRNA WITH A STOP CODON IN THE A-SITE. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME IN COMPLEX WITH TRNAS AND MRNA WITH A STOP CODON IN THE A-SITE AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 6.46 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2613, 2633), (2618, 2625) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GGCAUAA_-_UGUC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 4: C4'-exo, 7: C4'-exo, 9: C2'-exo, 12: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn, 4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |