Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-5-Internal Loop pdb2b9p1A.n2388-2398 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2b9p:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | 50S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME IN COMPLEX WITH TRNAS AND MRNA WITH A STOP CODON IN THE A-SITE. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME IN COMPLEX WITH TRNAS AND MRNA WITH A STOP CODON IN THE A-SITE AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 6.46 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2382, 2404), (2388, 2398) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CCCGA_-_GGCGG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: O4'-endo, 2: C4'-exo, 5: C2'-exo, 6: C1'-endo, 7: C4'-exo, 10: C2'-exo, 11: C2'-exo, 12: C2'-exo, 13: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |