Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '15-Segment pdb2b9p1A.i2053-2069 | |||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2b9p:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | 50S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME IN COMPLEX WITH TRNAS AND MRNA WITH A STOP CODON IN THE A-SITE. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME IN COMPLEX WITH TRNAS AND MRNA WITH A STOP CODON IN THE A-SITE AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 6.46 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (2053, 2069) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _ACGAAAAGACCCCGU_ | ||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 4: C2'-exo, 6: C2'-exo, 7: C1'-exo, 9: C2'-exo, 10: O4'-endo, 12: C2'-exo, 15: C2'-exo, 17: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||