Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '6-Hairpin pdb2b9p1A.e909-916 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 2b9p:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | 50S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME IN COMPLEX WITH TRNAS AND MRNA WITH A STOP CODON IN THE A-SITE. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME IN COMPLEX WITH TRNAS AND MRNA WITH A STOP CODON IN THE A-SITE AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 6.46 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (909, 916) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CCACCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo, 4: C4'-exo, 5: C4'-exo, 6: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn, 6: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||