Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-4-Internal Loop pdb2b641A.n1230-1261 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2b64:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | 30S RIBOSOMAL SUBUNIT, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF1 FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF1 FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX". THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS ONE 70S RIBOSOME, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF1 AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 5.90 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1232, 1259), (1235, 1254) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AU_-_UAAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C4'-exo, 3: C4'-exo, 5: C4'-exo, 7: O4'-endo, 8: C1'-exo, 9: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn, 6: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |