Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'17-Segment pdb2aw41B.i2228-2246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2aw4:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE BACTERIAL RIBOSOME FROM ESCHERICHIA COLI AT 3.5 A RESOLUTION. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT OF ONE 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINS TWO 70S RIBOSOMES AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.46 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2228, 2246) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GCACGAAGGUUGGCUAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C4'-exo, 7: C4'-exo, 8: C2'-endo, 16: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn, 7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |