Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'7-Segment pdb2au41A.i28-36 | |||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 2au4:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||
Source: Information | CLASS I GTP APTAMER | ||||||||||||||||||||
Source: Compound | CLASS I RNA APTAMER TO GTP | ||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||
Position | (28, 36) | ||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GUGAAAA_ | ||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: O4'-endo, 2: C1'-endo, 3: C4'-exo, 5: C3'-exo, 6: C2'-exo, 7: O4'-endo, 9: C4'-exo | ||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn, 8: syn | ||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||
Structural Clusters |