Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-1-Internal Loop pdb2a9x12.n1-28 | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 2a9x:2 (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | TAR RNA RECOGNITION BY A CYCLIC PEPTIDOMIMETIC OF TAT PROTEIN | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | BIV TAR RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (6, 23), (10, 21) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UGU_-_C_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 2: C1'-exo, 3: C2'-endo, 4: C2'-endo, 5: C4'-exo, 6: C2'-exo, 8: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||