Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'7-Hairpin pdb1ze21C.e8-16 | |||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1ze2:C (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CONFORMATIONAL CHANGE OF PSEUDOURIDINE 55 SYNTHASE UPON ITS ASSOCIATION WITH RNA SUBSTRATE | ||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 5'-R(*GP*GP*CP*CP*AP*CP*GP*GP*UP*(FHU) | ||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
Position | (8, 16) | ||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UUCGAAU_ | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 2: C2'-endo, 3: C3'-exo, 4: C2'-endo, 5: C2'-endo, 6: C2'-endo, 7: C2'-endo, 8: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn, 6: syn | ||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |