Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-4-Internal Loop pdb1yshFF.n17-27 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1ysh:F (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | LOCALIZATION AND DYNAMIC BEHAVIOR OF RIBOSOMAL PROTEIN L30E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
RNA (34-MER) FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 9.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (12, 33), (17, 27) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGGAA_-_GGAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: O4'-exo, 5: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C4'-exo, 11: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
8: syn, 9: syn, 11: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |