Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '1-2-Internal Loop pdb1ync1A.n1-31 | |||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1ync:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | NMR STRUCTURE OF THE APOB MRNA STEM-LOOP AND ITS INTERACTION WITH THE C TO U EDITING APOBEC1 COMPLEMENTARY FACTOR | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | APOLIPOPROTEIN B MRNA | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (6, 26), (8, 23) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _A_-_GU_ | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 6: C1'-endo, 7: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||