Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'6-5-Internal Loop pdb1ylsFD.n17-28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1yls:D (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF SELENIUM-MODIFIED DIELS-ALDER RIBOZYME COMPLEXED WITH THE PRODUCT OF THE REACTION BETWEEN N- PENTYLMALEIMIDE AND COVALENTLY ATTACHED 9- HYDROXYMETHYLANTHRACENE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
RNA DIELS-ALDER RIBOZYME FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 3.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (11, 35), (17, 28) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AAUACU_-_UGCCG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 2: C2'-endo, 3: C1'-endo, 4: O4'-endo, 6: C2'-exo, 13: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |