Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '6-5-Internal Loop pdb1ylsFB.n17-28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1yls:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF SELENIUM-MODIFIED DIELS-ALDER RIBOZYME COMPLEXED WITH THE PRODUCT OF THE REACTION BETWEEN N- PENTYLMALEIMIDE AND COVALENTLY ATTACHED 9- HYDROXYMETHYLANTHRACENE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
RNA DIELS-ALDER RIBOZYME FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (11, 35), (17, 28) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AAUACU_-_UGCCG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C1'-exo, 3: C2'-exo, 4: O4'-endo, 12: C2'-exo, 13: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||