Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'1-2-Internal Loop pdb1ylg1A.n8-23 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1ylg:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | NMR STRUCTURE OF THE APOB MRNA STEM-LOOP AND ITS INTERACTION WITH THE C TO U EDITING APOBEC1 COMPLEMENTARY FACTOR | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | APOLIPOPROTEIN B MRNA | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||
Position | (6, 26), (8, 23) | ||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _A_-_GU_ | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 3: C2'-exo, 4: C2'-exo, 6: C2'-exo, 7: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |