Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '8-Hairpin pdb1ylg1A.e11-20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1ylg:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | NMR STRUCTURE OF THE APOB MRNA STEM-LOOP AND ITS INTERACTION WITH THE C TO U EDITING APOBEC1 COMPLEMENTARY FACTOR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | APOLIPOPROTEIN B MRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (11, 20) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _ACAAUUUG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-exo, 7: C1'-endo, 8: C1'-endo, 9: C2'-exo, 10: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||