Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'9-5-Internal Loop pdb1yl3FA.n2606-2765 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1yl3:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF 70S RIBOSOME WITH THRS OPERATOR AND TRNAS. LARGE SUBUNIT. THE COORDINATES FOR THE SMALL SUBUNIT ARE IN THE PDB ENTRY 1YL4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
23S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 5.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2610, 2761), (2616, 2751) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AAGAUGAGG_-_CUUGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 3: C2'-exo, 4: C4'-exo, 6: C2'-exo, 8: C1'-endo, 14: C4'-exo, 15: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
8: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |