Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'27-Segment pdb1yl31A.i291-319 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1yl3:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF 70S RIBOSOME WITH THRS OPERATOR AND TRNAS. LARGE SUBUNIT. THE COORDINATES FOR THE SMALL SUBUNIT ARE IN THE PDB ENTRY 1YL4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 5.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (291, 319) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C4'-exo, 10: C2'-exo, 13: C2'-exo, 14: C2'-exo, 15: C2'-exo, 16: C2'-exo, 18: C4'-exo, 22: C2'-exo, 23: C4'-exo, 24: C2'-exo, 27: C2'-exo, 29: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
8: syn, 14: syn, 17: syn, 27: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Structural Clusters |