Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'22-Segment pdb1yl31A.i201-224 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1yl3:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF 70S RIBOSOME WITH THRS OPERATOR AND TRNAS. LARGE SUBUNIT. THE COORDINATES FOR THE SMALL SUBUNIT ARE IN THE PDB ENTRY 1YL4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 5.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (201, 224) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGGAGAGGAAAGAGAAAUCGAC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C4'-exo, 6: C2'-exo, 7: C4'-exo, 10: C2'-exo, 11: C4'-exo, 12: C4'-exo, 17: C4'-exo, 19: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
10: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |