Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'11-Hairpin pdb1yl31A.e2567-2579 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1yl3:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF 70S RIBOSOME WITH THRS OPERATOR AND TRNAS. LARGE SUBUNIT. THE COORDINATES FOR THE SMALL SUBUNIT ARE IN THE PDB ENTRY 1YL4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 5.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2567, 2579) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GUCGUGAGACA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 3: C4'-exo, 7: C4'-exo, 8: C4'-exo, 9: C2'-exo, 12: C4'-exo, 13: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
12: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |