Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-6-Internal Loop pdb1ykq1D.n17-28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1ykq:D (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF DIELS-ALDER RIBOZYME | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | DIELS-ALDER RIBOZYME | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (11, 35), (17, 28) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UGCCA_-_AAUACU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 12: O4'-endo, 13: C1'-endo, 14: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |